团委是青少年团员的基地，是学生工作开展的中心，也是南海中学优秀学生的代表和先锋队。南海中学团委由组织部和学宣部两大部门构成。 组织部分为行政分部和财政分部。行政分部主要职责有：负责起草团组织各项制度和规定，并监督基层组织执行；负责团干部选拔、培养、管理，组织团校、团干部上岗培训等培训工作；负责团的基层组织、团干部及广大团员情况的统计，团员发展、注册及团籍管理、团费收缴；组织评优工作，负责先进集体、个人的材料整理，及时向上级报告；定期组织团组织活动，例如成人宣誓活动、新团员宣誓仪式、敬老探望活动等。财务分部是团委学生会必不可少的重要组成部分,是团委学生会的物质保障,掌管团委学生会的一切资金，其主要职责有：收缴各级的团费及代收其他款项；团委学生会内部各项支出报销，收支登记以及一些简单的银行业务；开展每月一度的垃圾二次回收并进行相应的财务管理。
学宣部主要负责校团委的所有宣传工作，管理校团委网站、宣传橱窗、微博等，及时宣传校团委主办的各种活动，并向校广播台、电视台、校报等部门发送校内各项活动情况的相关报道。